月影岛的惊涛骇浪归于平静后，柯南（新一）和小兰的生活似乎又回到了日常的轨道。然而，这份平静并未持续太久，一场看不见硝烟的战争在东京地方法院的法庭上悄然打响。
事件的中心，是小兰的母亲，被誉为“法庭女王”的妃英理律师。她这次接手的案件相当棘手——为一位被指控商业欺诈和挪用巨额公款的知名企业中层管理干部，藤田弘辩护。而站在她对面的，则是以铁面无私、证据链构建严密着称的王牌检察官——九条玲子。
九条检察官素有“铁之九条”的称号，她作风强硬，思维缜密，尤其擅长利用看似不起眼的物证和证言间的矛盾，将对手逼入死角。这一次，她显然有备而来，针对藤田弘的指控证据环环相扣，尤其是关键的财务流水和邮件往来记录，几乎将藤田弘钉死在了被告席上。
即使强如妃英理，面对九条精心编织的证据网，也感到了前所未有的压力。连续几天的庭审，九条检察官步步紧逼，不断抛出新的“炸弹”，而妃英理试图找出证据链上的漏洞或证言的矛盾点，却总被九条以更详实的资料和更犀利的逻辑反击回来。英理办公室的灯常常亮到深夜，烟灰缸里的烟蒂也比平时多了不少，眉宇间带着明显的疲惫和凝重。
小兰敏锐地察觉到了母亲的焦虑。在一次周末探望时，看着母亲眼下淡淡的青黑，小兰心疼不已。她想到了身边最可靠的“智囊”——虽然外表是个小学生。
“新一～，”在英理暂时离开客厅去接电话时，小兰蹲下身，小声地对柯南说，“妈妈这次的对手好厉害，她看起来好累…新一，你能帮帮妈妈吗？就像以前帮爸爸破案那样？”小兰的眼神里充满了信任和恳求。
柯南（新一）看着小兰担忧的神情，毫不犹豫地点头：“嗯！兰，你放心，我会想办法的！不过，我们需要光明正大的理由去了解案情。”
于是，小兰以“带柯南来陪陪妈妈，顺便让柯南见识一下律师的工作”为理由，带着柯南频繁地出入英理律师事务所。柯南凭借着小孩子的“无害”外表和“天真”的好奇心，得以“旁听”英理和助手的案情分析会议，甚至“不小心”翻看了一些摆在桌上的、非核心的案卷材料复印件。他那颗侦探的大脑飞速运转，将听到的每一个细节、看到的每一份文件碎片都牢牢记下，并开始在心中默默梳理案件的脉络和九条证据链的关键节点。
与此同时，一个意想不到的人，也以超乎寻常的热情投入了这场“战役”——毛利小五郎。
虽然平时总是嘴硬，对英理分居耿耿于怀，各种吐槽她“不可爱”、“强势”，但得知英理在法庭上遇到了强劲对手，甚至可能面临职业生涯的重要挫折时，毛利小五郎骨子里那份属于前刑警的敏锐和属于丈夫（哪怕分居）的责任感瞬间被点燃了。
“哼！那个九条检察官，以为对手是谁啊？那可是我毛利小五郎的…咳，前妻！”在波洛咖啡厅，毛利小五郎灌下一口啤酒，独自嚷嚷着，“英理那女人虽然讨厌，但能力是没话说的！肯定是九条用了什么不光彩的手段！”