与此同时，刚刚在阿笠博士家试图用游戏转移自己注意力的柯南在之后回去毛利侦探事务所时，意外接到了目暮警官紧急打给“毛利小五郎”的电话（电话被柯南用变声器接听）。得知下一个目标是帝丹高中，柯南的大脑“嗡”的一声，一片空白。
小兰！小兰在那里！
所有的理智、所有的逃避念头瞬间被粉碎！极致的恐惧如同冰冷的毒蛇缠住了他的心脏，让他几乎窒息。他猛地从椅子上跳下来，连变声器都忘了关，对着话筒嘶吼道：“小兰！小兰在帝丹高中！！”声音里充满了前所未有的惊慌和绝望。
电话那头的目暮警官都愣住了：“毛…毛利老弟？”
柯南已经顾不上任何伪装了！他像疯了一样冲出博士家，小小的身体爆发出惊人的速度，朝着帝丹高中的方向狂奔而去！什么隐藏身份，什么危险，统统抛到了脑后！他脑海里只有一个念头：去救小兰！一定要救下小兰！
帝丹高中内，疏散正在有序进行，但人数众多，进展不可能瞬间完成。警方迅速封锁现场，拆弹小组火速赶往根据提示信息推测出的可能安装点——旧校舍即将拆除的体育馆储物间。
柯南以不可思议的速度赶到，无视警戒线，利用娇小的身材从混乱和缝隙中钻了进去。他心脏狂跳，呼吸急促，眼中只有那个目标地点。
“柯南？！你怎么在这里！快出去！危险！”正在指挥疏散的佐藤美和子看到了他，惊叫道。
“小兰姐姐呢？！”柯南根本不理会，只是焦急地大喊。
“小兰和园子应该已经跟着大部队往安全区撤离了！你别担心！快离开！”高木也试图拦住他。
得知小兰暂时安全，柯南紧绷的神经稍微松了一丝，但危机并未解除！炸弹还在！他必须阻止爆炸！
“让我进去！我知道炸弹可能在哪里！”柯南的声音带着不容置疑的坚定，眼神锐利如刀，完全不像一个孩子。他瞬间切换到侦探模式，根据对学校的熟悉和对炸弹魔提示信息的分析，他指向了一个比警方推测更精确的位置——储物间深处一个废弃的体操垫堆后面。
时间紧迫！拆弹专家来不及细想，在佐藤的默许下，柯南被带到了炸弹前。
冰冷的倒计时器在昏暗的光线下闪烁着红光：00:05:27… 26… 25…
一个结构复杂、布满红蓝导线的炸弹赫然在目！与七年前松田阵平面对的那枚，何其相似！
柯南的心猛地一沉，冷汗瞬间浸湿了后背。但他强迫自己冷静下来。松田警官…当年你面对的是怎样的压力？他深吸一口气，脑海中飞速闪过所有关于爆炸物的知识，双手稳定得可怕。他拿出随身携带的简易工具（来自阿笠博士的“小发明”），小心翼翼地开始检查线路。
佐藤美和子守在门口，看着那个小小的身影蹲在巨大的炸弹前，专注而勇敢的背影，恍惚间仿佛与记忆中那个叼着烟、手指翻飞的身影重叠… 松田…她紧紧握住了拳头，指甲几乎嵌进肉里。
时间一分一秒流逝，空气凝固得如同固体。高木和其他警员在外面焦急地等待，每一秒都像一年那么漫长。
柯南的额头布满细密的汗珠，他排除了一个又一个陷阱线路，最终目光锁定在两根几乎一模一样的蓝线上。经典的“红蓝选择”！七年前，松田就是在最后一刻赌错了蓝线… 不！不能赌！必须找出区别！
他屏住呼吸，凑得更近，用放大镜仔细观察导线的细微纹路和接口处的焊点痕迹。突然，他眼中精光一闪！其中一根蓝线的绝缘层在接口处有一道极其细微、几乎无法察觉的压痕！这是安装时被工具不小心压到的痕迹！
“就是它！”柯南毫不犹豫地拿起绝缘钳，对准那根有压痕的蓝线，在倒计时即将进入最后十秒的惊悚时刻——
咔嚓！
清脆的断裂声响起！
闪烁的红灯，倏然熄灭！
“成…成功了！”柯南脱力般跌坐在地上，大口喘着气，心脏还在狂跳不止。他做到了！他救下了这所学校，也间接保护了可能还未完全疏散的小兰！
门外的佐藤美和子冲了进来，看到停止的倒计时器，又看着瘫坐在地却成功拆除了炸弹的柯南，眼眶瞬间红了。她蹲下身，用力抱了抱这个不可思议的孩子，声音哽咽：“谢谢你…柯南…真的谢谢你…” 这不仅是对柯南的感谢，更像是对当年那个未能完成的遗憾，一丝迟来的慰藉。
危机解除，帝丹高中一片劫后余生的庆幸。小兰在安全区得知消息，不顾一切地跑回旧校舍，看到安然无恙的柯南，冲过去紧紧抱住他，眼泪止不住地流：“柯南！你吓死我了！你没事真是太好了！”柯南感受着小兰温暖的怀抱和剧烈的心跳，所有的恐惧和疲惫仿佛都消散了，只剩下满满的安心。
然而，就在众人以为一切结束时，被警方在帝丹高中外围抓获的炸弹魔（一个对当年松田阵平拆弹失误导致其亲人间接受伤而心怀怨恨的极端分子）在被押上警车前，突然回头，脸上露出一个疯狂而扭曲的笑容，对着目暮警官等人嘶吼道：
“你们以为结束了吗？蠢货！还有一份大礼呢！东都铁塔！就在观光层的了望台！时间…哈哈哈，应该快到了吧！让整个东京都为我们陪葬吧！！”